Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms