Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms