Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pin4Q9CWW6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pin4Q9CWW6 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pin4Q9CWW6 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pin4Q9CWW6 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pin4Q9CWW6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Pin4Q9CWW6 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pin4Q9CWW6 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms