Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ1

Cox6c, Cytochrome c oxidase subunit 6C, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6cQ9CPQ1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Col6a5-201ENSMUST00000165165 8046 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Ctnnd1-207ENSMUST00000111676 5852 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Cox6cQ9CPQ1 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms