Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlgn1Q99K10 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms