Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms