Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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