Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms