Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna12Q80SS5 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ifna12Q80SS5 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ifna12Q80SS5 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ifna12Q80SS5 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms