Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
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