Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Ccdc18Q640L5 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Ccdc18Q640L5 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Ccdc18Q640L5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Ccdc18Q640L5 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Ccdc18Q640L5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Ccdc18Q640L5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Ccdc18Q640L5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Ccdc18Q640L5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Ccdc18Q640L5 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Ccdc18Q640L5 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc18Q640L5 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms