Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN9AQ15858 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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