Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LmnaP48678 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms