Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01748 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01748 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms