Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
EdaO54693 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
EdaO54693 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EdaO54693 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EdaO54693 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
EdaO54693 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EdaO54693 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
EdaO54693 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EdaO54693 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
EdaO54693 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EdaO54693 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EdaO54693 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
EdaO54693 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.3 ms