Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms