Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21976J3QNN2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms