Protein–RNA interactions for Protein: J3QM38

Zfp994, Zinc finger protein 994, mousemouse

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Length 661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp994J3QM38 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Zfp994J3QM38 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Zfp994J3QM38 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Zfp994J3QM38 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Zfp994J3QM38 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Zfp994J3QM38 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Zfp994J3QM38 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Zfp994J3QM38 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Zfp994J3QM38 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Zfp994J3QM38 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Zfp994J3QM38 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms