Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Myo5cE9Q1F5 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms