Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms