Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Lgr5Q9Z1P4 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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Lgr5Q9Z1P4 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Lgr5Q9Z1P4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Lgr5Q9Z1P4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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