Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Med27Q9DB40 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
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Med27Q9DB40 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Med27Q9DB40 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
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Med27Q9DB40 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Med27Q9DB40 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms