Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C3

Alg13, Putative bifunctional UDP-N-acetylglucosamine transferase and deubiquitinase ALG13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg13Q9D8C3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Alg13Q9D8C3 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms