Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Use1Q9CQ56 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Use1Q9CQ56 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Use1Q9CQ56 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Use1Q9CQ56 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Use1Q9CQ56 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Use1Q9CQ56 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Use1Q9CQ56 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Use1Q9CQ56 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Use1Q9CQ56 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Use1Q9CQ56 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms