Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup155Q99P88 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms