Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a6bQ99N09 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms