Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms