Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Slc8b1Q925Q3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Slc8b1Q925Q3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
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Slc8b1Q925Q3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Slc8b1Q925Q3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Slc8b1Q925Q3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Slc8b1Q925Q3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Slc8b1Q925Q3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Slc8b1Q925Q3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Slc8b1Q925Q3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Slc8b1Q925Q3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Slc8b1Q925Q3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms