Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gtf3c1Q8K284 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gtf3c1Q8K284 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gtf3c1Q8K284 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gtf3c1Q8K284 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gtf3c1Q8K284 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gtf3c1Q8K284 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gtf3c1Q8K284 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gtf3c1Q8K284 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gtf3c1Q8K284 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gtf3c1Q8K284 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gtf3c1Q8K284 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gtf3c1Q8K284 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gtf3c1Q8K284 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gtf3c1Q8K284 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gtf3c1Q8K284 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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