Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 2,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Arhgef17Q80U35 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Arhgef17Q80U35 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Arhgef17Q80U35 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Arhgef17Q80U35 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arhgef17Q80U35 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arhgef17Q80U35 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arhgef17Q80U35 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arhgef17Q80U35 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arhgef17Q80U35 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arhgef17Q80U35 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arhgef17Q80U35 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arhgef17Q80U35 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arhgef17Q80U35 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arhgef17Q80U35 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arhgef17Q80U35 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arhgef17Q80U35 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arhgef17Q80U35 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arhgef17Q80U35 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arhgef17Q80U35 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arhgef17Q80U35 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arhgef17Q80U35 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arhgef17Q80U35 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arhgef17Q80U35 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arhgef17Q80U35 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Arhgef17Q80U35 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Arhgef17Q80U35 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Arhgef17Q80U35 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Arhgef17Q80U35 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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