Protein–RNA interactions for Protein: Q76LL6

Fhod3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod3Q76LL6 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod3Q76LL6 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fhod3Q76LL6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fhod3Q76LL6 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fhod3Q76LL6 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Fhod3Q76LL6 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fhod3Q76LL6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fhod3Q76LL6 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fhod3Q76LL6 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fhod3Q76LL6 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod3Q76LL6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod3Q76LL6 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod3Q76LL6 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod3Q76LL6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod3Q76LL6 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod3Q76LL6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod3Q76LL6 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod3Q76LL6 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod3Q76LL6 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod3Q76LL6 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod3Q76LL6 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod3Q76LL6 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod3Q76LL6 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod3Q76LL6 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms