Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms