Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5dQ62240 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5dQ62240 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5dQ62240 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5dQ62240 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5dQ62240 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5dQ62240 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5dQ62240 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5dQ62240 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5dQ62240 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5dQ62240 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5dQ62240 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5dQ62240 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Kdm5dQ62240 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Kdm5dQ62240 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Kdm5dQ62240 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Kdm5dQ62240 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms