Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms