Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fchsd2Q3USJ8 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms