Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Plgrkt-208ENSMUST00000143467 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Krr1-204ENSMUST00000174653 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Rpl31-201ENSMUST00000086535 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Olfr700-202ENSMUST00000214840 1505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm8952-201ENSMUST00000206828 1102 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Olfr209-203ENSMUST00000208875 1194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 AC170810.2-201ENSMUST00000228384 1232 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Snx7-205ENSMUST00000198499 1314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Tpt1-ps2-201ENSMUST00000120548 521 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox12Q04890 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms