Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms