Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1sQ02789 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms