Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms