Protein–RNA interactions for Protein: P61022

Chp1, Calcineurin B homologous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp1P61022 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chp1P61022 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chp1P61022 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Chp1P61022 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms