Protein–RNA interactions for Protein: P52480

Pkm, Pyruvate kinase PKM, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkmP52480 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PkmP52480 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PkmP52480 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PkmP52480 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PkmP52480 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PkmP52480 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PkmP52480 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PkmP52480 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PkmP52480 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PkmP52480 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PkmP52480 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PkmP52480 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PkmP52480 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PkmP52480 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PkmP52480 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PkmP52480 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PkmP52480 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PkmP52480 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PkmP52480 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PkmP52480 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PkmP52480 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PkmP52480 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PkmP52480 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PkmP52480 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PkmP52480 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PkmP52480 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PkmP52480 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PkmP52480 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PkmP52480 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PkmP52480 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PkmP52480 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PkmP52480 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PkmP52480 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms