Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
TtrP07309 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TtrP07309 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
TtrP07309 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TtrP07309 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
TtrP07309 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms