Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms