Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20828J3KMI7 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Gm20828J3KMI7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Gm20828J3KMI7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Gm20828J3KMI7 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Gm20828J3KMI7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Gm20828J3KMI7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms