Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnmal2G3X9N3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnmal2G3X9N3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnmal2G3X9N3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnmal2G3X9N3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnmal2G3X9N3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnmal2G3X9N3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnmal2G3X9N3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnmal2G3X9N3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnmal2G3X9N3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnmal2G3X9N3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnmal2G3X9N3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnmal2G3X9N3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnmal2G3X9N3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnmal2G3X9N3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnmal2G3X9N3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnmal2G3X9N3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnmal2G3X9N3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnmal2G3X9N3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnmal2G3X9N3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnmal2G3X9N3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnmal2G3X9N3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnmal2G3X9N3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnmal2G3X9N3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnmal2G3X9N3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms