Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt6bQ9Z331 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt6bQ9Z331 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt6bQ9Z331 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt6bQ9Z331 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt6bQ9Z331 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt6bQ9Z331 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt6bQ9Z331 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt6bQ9Z331 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Krt6bQ9Z331 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt6bQ9Z331 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt6bQ9Z331 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms