Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
Ccne2Q9Z238 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccne2Q9Z238 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccne2Q9Z238 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccne2Q9Z238 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccne2Q9Z238 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccne2Q9Z238 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccne2Q9Z238 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccne2Q9Z238 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccne2Q9Z238 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccne2Q9Z238 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccne2Q9Z238 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccne2Q9Z238 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccne2Q9Z238 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccne2Q9Z238 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccne2Q9Z238 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccne2Q9Z238 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccne2Q9Z238 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccne2Q9Z238 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccne2Q9Z238 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccne2Q9Z238 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccne2Q9Z238 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccne2Q9Z238 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccne2Q9Z238 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccne2Q9Z238 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccne2Q9Z238 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccne2Q9Z238 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccne2Q9Z238 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccne2Q9Z238 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccne2Q9Z238 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccne2Q9Z238 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccne2Q9Z238 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccne2Q9Z238 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms