Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R3

Apom, Apolipoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApomQ9Z1R3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ApomQ9Z1R3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApomQ9Z1R3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms