Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfrp4Q9Z1N6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 364.2 ms