Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddx39bQ9Z1N5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms